Με τον νόμο 3489/2006 συστάθηκε και η ανώνυμη εταιρεία «Αλεξάνδρεια Ζώνη Καινοτομίας Α.Ε.» με αρχικό μέτοχο το Ελληνικό Δημόσιο και δυνατότητα συμμετοχής σταδιακά μετόχων από τον ιδιωτικό τομέα και με αποστολή τη διαχείριση και την ανάπτυξη της Ζώνης Καινοτομίας Θεσσαλονίκης.
Η εταιρία λειτουργεί από τον Αύγουστο του 2007 και εποπτεύεται από το Υπουργείο Ανάπτυξης Ανταγωνιστικότητας και Ναυτιλίας.
Η σύσταση του νέου (ορίστηκε τον Ιούλιο του 2010) Διοικητικού Συμβουλίου της Αλεξάνδρειας Ζώνης Καινοτομίας ΑΕ με εκπροσώπους της Ακαδημαϊκής Κοινότητας, του Ιδιωτικού Παραγωγικού και Οικονομικού Τομέα, της Τοπικής Αυτοδιοίκησης και παρόμοιου Φορέα του εξωτερικού εγγυάται την διασύνδεση της Έρευνας με την Παραγωγή για την τοπική ανάπτυξη:
Πρόεδρος, Ελευθέριος Ιακώβου, Καθηγητής Α.Π.Θ.
Αναπληρωτής Προέδρου, Θεόδωρος Παπαδόπουλος, Δήμαρχος Θέρμης
Αναπληρωτής Αντιπροέδρου, Κωνσταντίνος Λοϊζος, Γ.Γ. Δήμου Εχεδώρου
Τακτικά - Αναπληρωματικά μέλη
Γεώργιος Μυλωνάς, Εκπρόσωπος Συνδέσμου Βιομηχανιών Βορείου Ελλάδος, τακτικό μέλος
Χριστόφορος Εδιάρογλου Σύμβουλος Επικοινωνίας, αναπληρωτής
Βασίλειος Μακιός, Ομότιμος Καθηγητής Παν/μίου Πατρών, εκπροσωπόντας κατά το Νόμο την Ευρωπαϊκή Ζώνη Καινοτομίας Σοφία Αντίπολη της Γαλλίας, τακτικό μέλος
Δημήτριος Λακασάς, Αντιπρόεδρος Συνδέσμου Εξαγωγέων Βορείου Ελλάδος, αναπληρωτής
Αθανάσιος Κωνσταντόπουλος, Διευθυντής Ι.Τ.ΧΗ.Δ., τακτικό μέλος
Χρήστος Σαραντόπουλος, Πρόεδρος Εμπορικού Τμήματος ΕΒΕΘ, αναπληρωτής
Στέργιος Λογοθετίδης, Καθηγητής Α.Π.Θ., τακτικό μέλος
Ιωάννης Μπακούρος, Αν. Καθηγητής Διαχείρισης Τεχνολογίας Πανεπιστημίου Δυτικής Μακεδονίας, αναπληρωτής
Ιωάννης Μανωλόπουλος, Πρόεδρος Τμήματος Πληροφορικής Α.Π.Θ., τακτικό μέλος
Νιόβη Παυλίδου, Καθηγήτρια Δικτύων Τηλεπικοινωνιών Α.Π.Θ., αναπληρώτρια
Ιωάννης Καζάζης, Καθηγητής Τμήματος Φιλολογίας Α.Π.Θ., τακτικό μέλος
Παναγιώτης Μπαμίδης, Επ. Καθηγητής Ιατρικής Πληροφορικής Α.Π.Θ. , αναπληρωτής
Παρασκευή Νάσκου- Περράκη, Καθηγήτρια Διεθνούς και Ευρωπαϊκού Δικαίου, Πανεπιστήμιο Μακεδονίας, τακτικό μέλος
Κωνσταντίνος Μαργαρίτης, Καθηγητής Εφαρμοσμένης Πληροφορικής Πανεπιστήμιο Μακεδονίας, αναπληρωτής
Αγγελική Ωραιοπούλου, Διευθύντρια ΔΙαχειριστικής Αρχής Περιφέρειας Κεντρικής Μακεδονίας, τακτικό μέλος
Κωνσταντίνος Παπαγεωργίου, Προϊστάμενος Κινήτρων Περιφερειακής Ανάπτυξης, Περιφέρειας Κεντρικής Μακεδονίας, αναπληρωτής
